目前，《抗日战争档案汇编·丽水市卷》作为国家确定和组织的重大专题开发项目，列入国家档案局抗战档案编辑计划。

丽水地区是浙江抗战的大后方，浙江省政府、建设厅、教育厅等机关和各类文化教育机构迁移至丽水各地。日本侵略军分别在1942年和1944年两次入侵丽水，在丽水各地施放鼠疾、伤寒、副伤寒和炭疽等病菌，造成丽水军民大量死伤，共导致1.57万人受害。 丽水档案馆中有大量民国时期县、乡镇、村上报的疫情报告、统计表;各级政府、部门的防疫计划、总结;省卫生处、县卫生院印发的训令、指令、布告;省政府、县政府印发的防疫办法，经费、药品发放通知;各类报刊关于疫情的报道;各机关、学校关于疫情的报告，停课、迁移的呈文等，这些珍贵的档案是侵华日军实施非人道的细菌战的最有力证据。丽水市档案馆通过对馆藏抗战期间日军细菌战的相关档案进行整理、数字化，编辑出版《抗日战争档案汇编·丽水市卷》。丽水市日军细菌战相关档案分散于市档案馆及除景宁县外的8个县（市、区）的档案馆中。经统计涉及细菌战的档案有41卷，计 333件，2361页，其中已完成数字化扫描238件，1855页，占总件数的71.5%、占总页数的78.6%。

《抗日战争档案汇编.丽水市卷》作为国家确定和组织的重大专题开发项目，目前已完成项目的填报工作。